Tyks
Laboratorioiden kliinisen mikrobiologian vastuualueen toiminta joutui
alkuvuodesta 2020 aivan uuden tilanteen eteen. Muutaman kuukauden aikana
näytteenotto- ja analyysikapasiteetti kasvoi valtavasti ja luotiin
uusia käytäntöjä matalan kynnyksen koronatestaamiseen. Toiminta on
jatkunut näin viime syksystä lähtien.

– Korona osoitti
maailmalle, miten tärkeää mikrobiologia on. Se on mukana monenlaisissa
terveysasioissa sekä hyvässä että pahassa, toiset epidemiat ovat
ennakoitavissa ja toiset ennakoimattomissa. Siksi yliopistotasoisen
kliinisen mikrobiologian laboratorion pitää koko ajan kehittää
diagnostiikkaansa ihan kuin formula 1-tallin autojaan, Tyksin
laboratoriotoimialueen johtaja Antti Hakanen sanoo.
–
Vuosi tai saatikka puolitoista vuotta sitten en olisi voinut kuvitella,
että tutkimme 2 500 hengitystienäytettä kiivaimpina päivinä tai että
meillä edes voisi olla olemassa kapasiteettia siihen, kliinisen
mikrobiologian vastuualuejohtaja Kaisu Rantakokko-Jalava sanoo.
Ennen
koronapandemiaa vuoden 2019 syyskaudella tehtiin 300-1200
hengitystievirusten PCR-tutkimusta kuukaudessa. Erityisen kovana
influenssakautena 2017-18 tehtiin marraskuusta toukokuuhun noin 12000
influenssatestiä. Jo se nähtiin silloin isona määränä.
Vuonna 2019
kliinisen mikrobiologian koko tutkimusmäärä oli 450 000 kappaletta,
josta kaikkien PCR-testien osuus oli noin 75 000. Viime vuonna pelkkiä
koronatestejä tehtiin 170 000. Nyt, kun on kulunut noin 15 kuukautta
koronaepidemia-aikaa, ollaan tutkittu kaiken kaikkiaan noin 325 000
koronanäytettä. Kapasiteetin hurjan nostamisen ja testin joustavan
kehittämisen on mahdollistanut se, että diagnostiikka nojaa isojen
automaattilaitteistojen sijasta omaan molekyylibiologian osaamiseen.
–
Jos meillä ei Suomessa olisi ollut Turun ja Helsingin yliopistollisten
keskussairaaloiden virologian laboratorioita, Suomen koronadiagnostiikka
olisi viivästynyt useilla kuukausilla, koska ensimmäiset kaupalliset
testit saatiin markkinoille vasta, kun epidemia oli jo käynnissä.
Pystytimme Tyksissä oman koronavirus PCR-menetelmän hyvin nopeasti
koronaviruksen perimän selvittyä ja muutamassa viikossa olimme valmiit
aloittamaan ensimmäiset testaukset, Tyksin molekyylimikrobiologian ja
virologian ylilääkäri Tytti Vuorinen sanoo.
–
Toimintamme pohjautuu vuosikymmenien tutkimustoimintaan ja yhteistyöhön
yliopiston kanssa, joten meillä oli hyvät valmiudet pystyttää
omavalmisteinen koronatesti nopeasti. Olemme myös etulinjassa
muuntovirusten tunnistamisessa omavalmisteisillä testeillä ja
sekvensoinnilla.
Teksti: Nadine Karell
Kuva: Mikael Soininen